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氟苯尼考耐藥基因floR LAMP檢測方法的建立及應用

作者:馮世文; 李軍; 潘艷; 彭昊; 賀會利; 鐘舒紅; 胡帥; 曾蕓 廣西獸醫研究所; 廣西南寧530001; 廣西獸醫生物技術重點實驗室; 廣西南寧530001; 廣西大學動物科學技術學院; 廣西南寧530004

摘要:為建立快速、靈敏且可定量檢測氟苯尼考耐藥基因floR的環介導等溫擴增方法(LAMP),根據GenBank登錄的革蘭陰性菌floR基因保守序列,利用PrimerExploerV4設計特異性LAMP引物,成功建立了快速檢測氟苯尼考耐藥floR基因的LAMP方法。該LAMP檢測方法反應溫度為63℃,反應時間為60min,具有可實時監測反應、定量檢測出floR基因的拷貝數,以及操作簡便的特點,靈敏度高,檢測限為6.24×100拷貝,是普通PCR的100倍。用建立的方法檢測對氟苯尼考不同敏感性的大腸埃希菌floR基因,結果顯示,對氟苯尼考敏感、中介和耐藥的菌株均檢測到floR基因,其拷貝數與菌株MIC相關,提示floR基因不僅存在于氟苯尼考耐藥菌中。所建立的floR基因LAMP檢測方法可為floR基因的監測,以及氟苯尼考耐藥性產生和傳播機制的研究提供新的技術手段。

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