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馬鈴薯MYB轉(zhuǎn)錄因子基因的序列分析

作者:劉旭婷; 范菠菠; 張旭婷; 王鵬偉; 高慧; 馬艷紅 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院; 呼和浩特010019

摘要:MYB基因家族是植物中最大的一類轉(zhuǎn)錄因子家族,廣泛參與植物的生長發(fā)育和代謝調(diào)控過程。本研究通過生物信息學(xué)方法對美國國立生物技術(shù)信息中心(national center for biotechnology information, NCBI)中篩選的16條馬鈴薯MYB基因進(jìn)行分析,預(yù)測其分子量和等電點(diǎn)等理化性質(zhì)、基序、二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu),并用MEGA 5.0與已報(bào)道具有明確功能的20個(gè)MYB蛋白進(jìn)行多序列比對分析并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果表明:馬鈴薯中篩選出16個(gè)的MYB基因蛋白大小在104~379 aa,分子量和等電點(diǎn)分別介于66 877.11~147 918.09 k D和4.95~5.16之間;基序預(yù)測得到3個(gè)特征基序,最長的基序含50個(gè)氨基酸;α-螺旋和無規(guī)則卷曲是主要的二級結(jié)構(gòu),三級結(jié)構(gòu)中都含有螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋結(jié)構(gòu);進(jìn)化樹分析中,其中StMYB12與SIMYB12同源性高,StMYBA1、St AN1和StMYB113與矮牽牛AN2同源性高,StMYB21與MdMYB1有同源性,推測馬鈴薯的St MYB12、St MYBA1、StAN2、St AN1、StMYB113和StMYB21可能參與花青素合成代謝調(diào)控,這為下一步馬鈴薯花色素苷合成調(diào)控相關(guān)MYB基因功能研究提供參考依據(jù)。

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