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番茄不同截短U3啟動子的克隆及功能分析

作者:蒲艷; 劉曉東; 阿爾祖古麗·塔什; 魏倩; 劉超 新疆農業大學農學院新疆農業大學農業生物技術重點實驗室; 新疆烏魯木齊830052

摘要:從中蔬四號番茄品種中克隆能在番茄葉片中高效轉錄的SlU3啟動子,為今后利用CRISPR/Cas9基因編輯技術進行分子育種奠定了基礎。采用2輪PCR的方法,第1輪PCR從中蔬四號番茄品種中克隆了3種SlU3啟動子,再采用Transfer PCR方法分別對3個啟動子進行截短,共得到6個不同長度的啟動子,并分別構建6個截短的SlU3啟動子驅動GUS融合植物表達載體,利用農桿菌轉化法分別轉染番茄葉片。運用DNAMAN軟件對已克隆的SlU3和擬南芥AtU3啟動子序列具有轉錄功能的必要元件進行序列分析;經過2輪PCR,首先從中蔬四號番茄品種中克隆了3種SlU3-1P、SlU3-3P、SlU3-4P啟動子,其長度分別是1 156,1 114,1 147 bp,再采用Transfer PCR方法分別對3個啟動子進行截短,共得到6個不同長度的啟動子,其長度依次是489,318,450,248,457,248 bp,并分別構建6個截短SlU3啟動子驅動GUS融合植物表達載體,啟動子序列比對分析發現,番茄U3啟動子與擬南芥U3啟動子一樣,也含有比較保守的2個元件,USE和TATA框,2個元件之間的位置比較固定。利用農桿菌轉化法分別轉染番茄葉片,結果顯示,成功侵染后的番茄葉片均被染成藍色,表明已克隆的6種不同截短番茄SlU3啟動子均具有轉錄活性。成功克隆了6種在番茄葉片中高效轉錄的SlU3啟動子,為構建番茄CRISPR/Cas9基因編輯載體提供更多高效的內源啟動子。

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