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玉米自交系響應花粒期高溫脅迫差異表達基因的分析

作者:李川; 喬江方; 朱衛(wèi)紅; 代書桃; 黃璐; 張美微; 劉京寶 河南省農(nóng)業(yè)科學院糧食作物研究所; 河南鄭州450002

摘要:為了探明玉米重要自交系花粒期高溫脅迫下轉(zhuǎn)錄組基因的表達差異,發(fā)掘玉米響應高溫脅迫的關鍵基因和蛋白質(zhì),明確高溫脅迫引起玉米減產(chǎn)的機理,從而利用分子生物學技術(shù)手段提高玉米耐高溫脅迫性。首先,利用AmphaTMZ30花粉活性分析儀檢測高溫脅迫和正常生長條件下玉米自交系昌7-2、鄭58的花粉活性。然后收集花粉提取總RNA,利用Illumina Hiseq2000TM高通量測序技術(shù)分別對昌7-2、鄭58花粒期高溫脅迫材料和正常生長條件下的對照材料進行全轉(zhuǎn)錄組測序,序列結(jié)果分析后獲得差異顯著表達基因。通過差異基因維恩圖(VENN圖)重疊區(qū)域分析、GO功能分類和富集統(tǒng)計、KEGG pathway通路分類和富集分析以及轉(zhuǎn)錄因子分析,獲得玉米花粒期高溫脅迫相關的重要差異表達基因和蛋白質(zhì)?;ǚ刍钚詸z測結(jié)果顯示,高溫脅迫后和正常生長條件下,昌7-2花粉活性分別為24. 37%,42. 89%,鄭58花粉活性分別為35. 57%,64. 83%。高溫脅迫后在昌7-2花粉轉(zhuǎn)錄組中共檢測到4 176個顯著差異表達基因,鄭58花粉轉(zhuǎn)錄組中共檢測到5 487個顯著差異表達基因。KEGG pathway通路分類和富集分析結(jié)果顯示,高溫脅迫后鄭58的花粉轉(zhuǎn)錄組中有2 062個差異表達基因富集到399個相關通路上,昌7-2的花粉轉(zhuǎn)錄組中有1 943個差異表達基因富集到352個相關通路上。轉(zhuǎn)錄因子分析結(jié)果表明,共獲得55個轉(zhuǎn)錄因子家族,其中,有45個轉(zhuǎn)錄因子包含10個以上差異表達基因。研究表明,通過對玉米自交系花粒期高溫脅迫后花粉轉(zhuǎn)錄組測序獲得了大量的差異顯著表達基因信息,昌7-2、鄭58對高溫脅迫響應機制存在明顯差異,熱激蛋白(Hsps)、熱激轉(zhuǎn)錄因子(Hsfs)、生長素(IAA)基因和磷脂?;?4,5-二磷酸基因家族(PIP2)在響應玉米花粒期高溫脅迫過程中起著重要作用。

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