摘要：【目的】克隆金線蓮辣椒紅素/玉紅素合成酶(capsanthin/capsorubin synthase,CCS)編碼基因并分析其功能。【方法】在金線蓮轉錄組測序數據基礎上,同源克隆福建金線蓮(Anoectochilus roxburghii)和臺灣金線蓮(Anoectochilus formasanus)的CCS基因編碼序列,并進行生物信息學分析和表達特性分析。【結果】福建金線蓮ArCCS基因的ORF長1 461 bp,編碼486個氨基酸。臺灣金線蓮AfCCS基因的ORF長1 458 bp,編碼485個氨基酸。ArCCS與AfCCS蛋白序列相似度為97%,均定位于葉綠體,二者理化性質和三級結構高度相似。ArCCS和AfCCS基因的表達顯著受鹽脅迫和不同光質的誘導或抑制。AfCCS基因在根中低表達,在莖中高表達,而ArCCS基因的表達無組織特異性。【結論】成功克隆到福建金線蓮和臺灣金線蓮的CCS基因,二者的表達受到環境因素的顯著誘導。