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PLUG引物和IT引物在頂芒山羊草分子標記建立中的通用性分析

作者:宮文萍; 李凱; 程敦公; 武智民; 李洪振; 韓冉; 李豪圣; 劉成; 劉建軍 山東省農業科學院作物研究所/農業部黃淮北部小麥生物學與遺傳育種重點實驗室/小麥玉米國家工程實驗室; 山東濟南250100; 魯東大學農學院; 山東煙臺264000; 山東省種子管理總站; 山東濟南250100; 武城縣農業局; 山東武城253300

摘要:分子標記是檢測和追蹤小麥背景中近緣物種染色體的重要手段。依據禾本科物種基因共線性原則,基于基因序列設計的引物在不同物種中可能具有通用性。本研究對水稻PLUG引物和簇毛麥IT引物在頂芒山羊草中的通用性進行了分析,并建立了頂芒山羊草染色體特異IT標記。供試的397對PLUG引物和841對IT引物對小麥-頂芒山羊草雙二倍體與中國春的擴增結果顯示,377對(95.0%)PLUG引物和593對(70.5%)IT引物可以在供試材料中擴增出清晰條帶。因此,PLUG引物在頂芒山羊草中的通用性優于IT引物。相比小麥對照,PLUG引物和IT引物能在小麥-頂芒山羊草雙二倍體中擴增出多態性條帶的引物數分別有17對和5對,分別占供試PLUG引物和IT引物的4.3%和0.6%。利用獲得的IT多態性引物對一套小麥-頂芒山羊草附加系和一套小麥-卵穗山羊草附加系進行擴增,結果發現僅引物CINAU1060、CINAU1465和CINAU1517能在相應附加系中擴增出大小分別約為300、480bp和320bp的多態性標記,為小麥背景中頂芒山羊草染色質的鑒定提供了新的檢測手段。然而,本研究中IT引物建立頂芒山羊草分子標記的比率僅為0.4%,低于我們之前用PLUG引物建立頂芒山羊草分子標記的比率(8.9%)。

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山東農業科學

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