摘要:肝細胞癌是全球癌癥相關死亡的主要原因,目前對肝細胞癌的發病機制研究尚不完善,探索肝細胞癌發生、發展相關的分子標志物及其預后具有重要意義。從GEO數據庫獲得肝細胞癌組織和非癌組織的基因表達陣列數據GSE84402,利用GEO2R篩選差異表達基因;采用DAVID數據庫對差異基因進行GO富集分析和KEGG通路分析;通過STRING數據庫和Cytoscape軟件構建差異表達基因對應的蛋白質相互作用網絡,并從網絡中篩選出核心基因(hub genes);結合KM plotter數據庫的臨床信息對hub genes進行預后分析。結果顯示:共得到1307個差異表達基因,其中上調基因741個,下調基因566個,這些差異表達基因主要涉及細胞分裂、細胞周期、DNA復制及物質代謝等生物學過程及生物通路。通過GO、KEGG及蛋白質相互作用網絡篩選出BUB1、BUB1B、CCNA2、CCNB1、CCNB2、CDC20、CDK1、MAD2L1、PLK1等9個hub genes,進一步分析發現hub genes均與細胞周期的調控相關,表明細胞周期的調控失常在肝細胞癌的發生、發展過程中具有重要作用。生存分析顯示9個hub genes在肝細胞癌患者中均為表達上調的基因,且與患者預后不良相關,這為尋找肝細胞癌患者預后相關生物標志物的研究提供了線索。
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