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馬鈴薯StSRP1的克隆、表達(dá)及生物信息學(xué)分析

作者:龐鵬湘; 常燕楠; 尉瑞敏; 郜剛 山西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 臨汾041004

摘要:脅迫相關(guān)基因的表達(dá)導(dǎo)致代謝物的積累和生化與生理途徑的改變,對于植物適應(yīng)不利脅迫條件至關(guān)重要。通過研究馬鈴薯StSRP1的結(jié)構(gòu)和在逆境脅迫中的表達(dá)情況,為驗證馬鈴薯StSRP1在抵抗生物脅迫過程中的作用奠定了基礎(chǔ)。運用電子克隆法獲得StSRP1全長序列,利用生物信息學(xué)分析StSRP1的核酸序列、氨基酸序列、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和啟動子,基于NCBI數(shù)據(jù)庫,選取20條與StSRP1匹配度高的脅迫相關(guān)蛋白序列構(gòu)建了系統(tǒng)進化樹,對不同物種間的SRP蛋白進行比對。經(jīng)ABA、MJ和病菌的誘導(dǎo),對StSRP1進行qRT-PCR分析。克隆獲得StSRP1全長867 bp,可編碼288個氨基酸,無信號肽序列,無跨膜區(qū),有34個可能的磷酸化位點,親水性蛋白,定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。StSRP1的表達(dá)受ABA、MJ和病菌的調(diào)控。StSRP1可能參與馬鈴薯逆境脅迫應(yīng)答過程。

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