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人呼吸道合胞病毒蘭州株基因組全長cDNA克隆的構建及鑒定

作者:朱傳鳳; 瓦曉霞; 包紅; 寇桂英; 傅生芳; 馬超 蘭州生物制品研究所有限責任公司第二研究室甘肅省疫苗工程技術研究中心; 甘肅蘭州730046

摘要:目的構建用于呼吸道合胞病毒(respiratorysyncytialvirus,RSV)體外拯救的RSV基因組全長cDNA克隆,并進行鑒定。方法根據RSVLong株基因組序列設計并合成引物,利用RT-PCR技術分6段擴增RSVLZ01/09基因組序列并構建克隆載體;測序后,利用重疊PCR與酶切連接技術,根據基因組序列選擇特異性酶切位點,引入KpnI、XmaI和SalI酶切位點,構建成4個亞克隆載體;將亞克隆載體的插入片段連接至經過改造且包含T7啟動子、錘頭狀核酶、多克隆位點、丁肝核酶、T7終止子的pRSV1載體中,構建RSV基因組全長cDNA克隆;對克隆全長cDNA序列進行測定,與親本RSVLZ01/09基因組進行同源性比對分析,并與RSV實驗參比株進行系統進化樹分析。結果測序結果顯示,RSVLZ01/09的基因組全長為15204bp,與GenBank公布的RSV基因組序列長度相當,將完整的序列提交GenBank,登錄號為KY782635;酶切及測序結果顯示,用于RSV全長cDNA克隆構建的基本載體pBSKS-MCS(簡稱pRSV1)與預期相符,RSV全長基因組cDNA克隆質粒(簡稱轉錄載體pRSV1-4F)酶切片段大小與預期一致;同源性比對結果顯示,全長cDNA序列與親本RSVLZ01/09基因組序列同源性高達99.83%;系統進化樹分析結果顯示,其與RSV-A亞型序列同屬于一個分支。結論測序及酶切分析結果表明已成功構建RSVLZ01/09基因組全長cDNA克隆,為建立拯救RSV重組病毒的反向遺傳學系統平臺奠定了基礎。

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