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豬Nrf2基因克隆、生物信息學分析及啟動子區轉錄活性分析

作者:劉宗立; 陳濤; 楊丹丹; 崔景香; 李川皓; 曾勇慶; 陳偉 山東農業大學動物科技學院; 泰安271018; 山東省動物生物工程與疾病防治重點實驗室; 泰安271018; 濰坊科技學院; 濰坊262700

摘要:旨在了解豬Nrf2基因的結構和功能,研究Nrf2基因的轉錄調控機制。本研究選取6頭90 kg左右的健康大蒲蓮豬為試驗動物,采用cDNA末端快速克隆技術(RACE)和染色體步移技術獲得大蒲蓮豬Nrf2基因完整的cDNA序列和啟動子區域,利用生物信息學軟件分析Nrf2基因及其啟動子區域的生物學特征。結果,Nrf2基因cDNA全長2 358 bp,包括87 bp的5′UTR,495 bp的3′UTR序列,CDS區大小為1 776 bp,編碼591個氨基酸。對預測蛋白質序列進行生物信息學分析,蛋白分子量為66.402 7 ku,理論等電點(pI)為4.66,大部分二級結構為α-螺旋。采用染色體步移技術擴增得到5′側翼序列2 091 bp的片段。Nrf2基因5′側翼區經預測含有典型的TATA-box,不含CpG島。構建不同長度啟動子片段的pGL3-Basic表達載體,轉染293T細胞后經雙熒光素酶活性檢測,提示在-903~-710 bp區域內可能存在正調控區或增強子,生物信息學預測其中含有多個轉錄因子結合位點,可能參與Nrf2基因轉錄調控。本研究成功獲得了Nrf2基因完整的cDNA序列和啟動子區域,并且發現-903~-710 bp為核心啟動子,本研究為豬抗氧化應激的遺傳改良提供一定理論基礎。

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