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玉米鄰甲基轉移酶基因bx12-ZaC546的克隆及其生物信息學分析

作者:史娟娟; 馮賀; 劉恩卓; 李鵬; 鄭大浩 延邊大學農學院; 吉林延吉133002

摘要:鄰甲基轉移酶是與玉米抗蟲性密切相關的苯并噁嗪類化合物生物合成中的關鍵酶之一,由bx12基因編碼。為深入研究bx12基因的表達與調控機理,該研究從我國玉米自交系ZaC546中克隆出了含有目的基因bx12的目標DN段Zm3325-ZaC546。測序結果證明:從ZaC546基因組中分離的目標DNA序列長度為1010bp,含有完整的開放閱讀框(ORF)。與玉米基因組數據庫上的參考序列相比,目標DNA序列在其ORF的內部,從起始密碼子的第1個堿基開始,下游第204個堿基位置上存在1個堿基突變,由G突變為A,遺傳密碼由AAG變為AAA,但氨基酸不變,都編碼賴氨酸(Lysine,K)。雖然,目標DNA序列在其ORF的下游,第883個堿基G發生缺失,第905個堿基由T突變為C,但因這2個突變位于ORF的下游,并不影響目的基因的編碼活性。目標DNA序列Zm3325-ZaC546與參考序列的一致性為99.70%,閱讀框序列的一致性為99.87%;而由目的基因編碼的蛋白質氨基酸序列與參考序列的一致性為100%。生物信息學分析結果表明:本研究中克隆的基因所編碼的鄰甲基轉移酶蛋白屬于鄰甲基轉移酶基因超級家族2。該酶是一種多功能酶,具有2個大的結構域,一個位于N-末端一側,具有甲基轉移酶蛋白二聚化功能;另一個位于C-末端一側,具有甲基轉移酶功能和鄰甲基轉移酶功能。

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延邊大學農學學報

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