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結合重組酶介導的核酸等溫擴增和熒光探針快速檢測日本血吸蟲基因片段

作者:趙松; 劉燕紅; 李婷; 李偉; 張鍵鋒; 郭利川; 應清界; 羊海濤; 楊坤 國家衛生和計劃生育委員會寄生蟲病預防與控制技術重點實驗室; 江蘇省寄生蟲與媒介控制技術重點實驗室; 江蘇省血吸蟲病防治研究所; 無錫214064; 江蘇省奇天基因生物科技有限公司; 無錫214064

摘要:目的結合重組酶介導的核酸等溫擴增(recombinase aided amplification, RAA)和熒光探針方法建立日本血吸蟲特異性基因片段的快速檢測方法。方法以日本血吸蟲G28 (Sj G28)基因片段作為靶序列,應用DNAMAN 7.0軟件設計合成引物及熒光探針,建立熒光RAA反應體系。擴增不同拷貝數的Sj G28重組質粒,評價熒光RAA檢測的敏感性;分別以日本血吸蟲、曼氏血吸蟲、細粒棘球絳蟲、十二指腸鉤口線蟲、似蚓蛔線蟲、華支睪吸蟲基因組為模板進行熒光RAA檢測,以評價該方法的特異性。采用熒光RAA分別檢測500、 200和50條日本血吸蟲尾蚴感染的兔糞中蟲卵DNA。分別在50只陰性釘螺中混入1、 2、 3、 4、 5、 10只陽性釘螺,并提取DNA進行熒光RAA檢測。結果以不同拷貝數的Sj G28重組質粒為模板進行熒光RAA擴增,在5 min時即可觀察到明顯的熒光信號,隨著拷貝數的不斷降低,檢測到熒光信號的時間也隨之延長,不同拷貝數的擴增均在10 min內完成,最低可檢出的質粒濃度為10拷貝/μl。以曼氏血吸蟲、細粒棘球絳蟲、十二指腸鉤口線蟲、似蚓蛔線蟲及華支睪吸蟲基因組DNA為模板的熒光RAA擴增結果均為陰性。不同數量尾蚴感染的兔糞中提取的DNA樣品經熒光RAA檢測,均能得到有效的擴增,檢測可在15 min內完成。含不同數量陽性釘螺的50只陰性釘螺提取的日本血吸蟲DNA經熒光RAA檢測,均能得到有效的擴增,檢測可在10 min內完成。結論本研究建立的可檢測日本血吸蟲核酸片段的熒光RAA方法,反應快捷,敏感性和特異性均較高。

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中國寄生蟲學與寄生蟲病

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