摘要:目的對比小鼠前后肢基因表達譜的變化,篩選小鼠后肢特異表達的基因。方法通過NCBIGEO數據庫查找小鼠前后肢基因表達芯片,使用Transcriptome Analysis Console軟件對原始數據(5個前肢E10.5d芯片及4個后肢E10.5d芯片)進行質控,利用差異倍數為2倍以上或0.5倍以下及P值小于0.05進行數據過濾,繪制差異表達基因的火山圖,并進行聚類分析,構建后肢特異表達基因的相互作用分子網絡圖。結果小鼠胚胎E10.5d后肢相較于前肢的差異表達的基因共有275個,其中上調的基因45個,下調的基因230個,構建了后肢特異表達的差異基因分子網絡圖,找到后肢特異表達核心基因,使用qPCR檢測部分后肢特異表達的基因,結果與芯片結果一致。結論應用小鼠表達譜芯片成功篩選出后肢特異表達的基因,為哺乳動物肢體發育的研究提供基礎。
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